mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTTGGCTCGACTCACTCAGA TGATTGAGCCGTGCCAATATC AGGAGGGTGGAATGGTCACTATGATGTTGGCTCGACTCACTCAGACCACGCCTGCCGGCCGGCCGTAGCCATGCATCTGCATGCGGTGGTGGCTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCTCAGTGCTCTTTCATGCATGC CGGACGCGTGGGCCCGTCGTCTCTCCTCCTTGACAGACCGACCGATCGATGGCGGGGAACCCCGACAGGAGGAGGGTGGAATGGTCACTATGATGTTGGCTCGACTCACTCAGACCACGCCTGCCGGCCGGCCGTAGCCATGCATCTGCATGCGGTGGTGGCTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCTCAGTGCTCTTTCATGCATGCATGCATGGGCTCGCTCCTTGTGCGCCGTGGTGCCTAGCTAGCTGGCTCCTCCGCCATGGTGCCAATATCTCAGTGCACGCTTCCTCACCTGCATGCGTTGCAGGGTTAACTCCCAGGAAGGGTTGGAGTAGGGCGGAGAGAAATGCACAACGTGTATCAAAGCTTCACCGCTTCTGCAGGCATAATCTGCCCACTGGAGGGCAAGGAAGTGGAGTATCCTGAACTGAAGATGAAGTTCAGCCTCGAGGCCCTTCAGATGGTTGCAGTTTGAACGCAGCGAGGCACGCACTGTAACACCGATGTATCAAGACAATGTTCCCAGGGGAAACATTCATGTAGTGTGTGTGATATGCTTGCTCCAATGTTCTATACACACACACAC 3 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR171_1 0.0000000005 tae-MIR171a 9e-70 -51.9 ......((((((.((.((((..(((((((((.((.((((.((((((((((((....)))..(((((....((((....))))))))).)))).))))).)))).)).)))))))))..)))))).))))))...... (-51.9)