mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTCCCTCCGTCCCAAAATAT ATTTTGGGATGGAGTACCATA CTCTATTTAGTACTCCCTCCGTCCCAAAATATAAGATCATTTTTTTATACTAAGATAGTGTCAAAAATGATCTTATATTTTGGGATGGAGTACCATATTATTACT GGCACGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAACTAGGGTCAGCCGATGAGCCTTGCGCCTGGTCGCTGGGAGTTGTTCCTGCGATGGAGCAGCAGTGATCGCATATGTAAATATTCCTGACCTGTCTTTTTACCAGTGGACATTGTATGATTCCGACATGCTGCCCTGCTGAACAGGACCGAGTGTAAGCAACCCTTTTGTGAGCATAGTTGCTTAATGCAGTCACTGGTGCATCACGCATGGGTTGTTGAAATTCCGACACGCTGCCCTGCTGAACAGGACCGAGTGTAAGATCAATGACTTGGGTTTGCTGCAGTACTTGTGAGCATAGTTGCTTAATGCTCTATTTAGTACTCCCTCCGTCCCAAAATATAAGATCATTTTTTTATACTAAGATAGTGTCAAAAATGATCTTATATTTTGGGATGGAGTACCATATTATTACTTGTAATGTAGTTGGAAGTTTTGTGTTGTTGAAATCTTTGAAATACGCTGAATACTCTTGGGTCATCTCCGAAACAAGACCAATTTTTCAAAAAACAAAAAAAAAAACTCGA 5 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 0.00000009 osa-MIR818d 0.000001 -40.6 ..((....))......((((((((((((((((((((((((((((..((((((...)))))).))))))))))))))))))))))))))))............... (-40.6)