mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTCCGTCCCAAAATAAGTGT ACTTATTTTGGGACGGAGGAA ACTCGGTACTTAGTGTTAATATGAAGTACTCCCTCCGTCCCAAAATAAGTGTCTCAAGCTTAGTTCAACTTTGTACTAAAGTTAGTACAAAGTTAAGACACTTATTTTGGGACGGAGGAAGTATTAAATTAGCTCTGCTATCTACTCA CGATCAACAGCGGCTATCAGTCATGGGGCCCACTTTTCGGGAAGCTCTTCTTTGCCTTCTGGGTGATTATCCACTTGTACCCATTCCTCAAGGGGCTCATGGGACGGCAGAACCGCACGCCGACCATTGTTGTCGTCTGGGCCATCCTTCTTGCATCCATTTTCTCCTTGCTGTGGGTTCGCATTGACCCGTTCACAACAAGAGTCACTGGGCCAGATATCCAAATGTGTGGCATCAACTGCTAGGAGAGTGCAAGATAACTGGAACAGAATTGTCACCCATTCTGTTGTATGATATTAGCGGGTGACACTAGTTTATCAGATGACCTTGGTTGTAAAAACTCGGTACTTAGTGTTAATATGAAGTACTCCCTCCGTCCCAAAATAAGTGTCTCAAGCTTAGTTCAACTTTGTACTAAAGTTAGTACAAAGTTAAGACACTTATTTTGGGACGGAGGAAGTATTAAATTAGCTCTGCTATCTACTCATTATATTATTATTAGTATATATATTATTGAAGCGGCAGAACAAGAATAAAAAAAAAAAAAAA 0 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 8e-40 tae-MIR1137 0.0000001 -59.9 ....((((..((((((((((.(((..((((.(((((((((((((((((((((((..(((...))).((((((((((((....)))))))))))).))))))))))))))))))))))).))))))).))))))...))))..)))).. (-59.9)