mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGGGAACAGGCAGAGCATGG ATGCACTGCCTCTTCCCTGGCT AATAAAAAAGGCTGGGAACAGGCAGAGCATGGATGCAGCTATTAACAGAAACTCTCTGTTTTGGCTTCACTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTTCTACCTC TCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGACATGGATATTTAAGATTGAGTGTTGTAAGACTTAGAATGTCTAATATGGCCTCGATATGTCCTAACTAATTTGGTGATTAGTTTCTGATTGGTCCTCGAAGTTTTTGATTGGTCAGGTAGTGGAATAAAAAAGGCTGGGAACAGGCAGAGCATGGATGCAGCTATTAACAGAAACTCTCTGTTTTGGCTTCACTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTTCTACCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTATTTAACAGTTTTTTCCTAATTCAATGATCATGAAATTTTTATTTTACTATTTTATTAATATTATGCTCTTTGATGAAGACGACTATCATTC 2 1 5' arm Euphorbia_esula mirnest MIR408 4e-16 ptc-MIR408 2e-17 -45.6 .........(((((((((.((((((.((((((.((.(((((..((((((.....)))))).))))).)).)))))).)))))).))))).))))........ (-45.6)