mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTCCCTCCGTCCCATAATAT ATTATGGGACGGGGGGGAGTAG AACAAAATCATACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGAGCGCTTTTGGTACTAGTGTAGTGTTAAAAACGCTCTTATATTATGGGACGGGGGGGAGTAGAATGCATG AAAGATTGTGCATTTGGAACTCACGTGGCTGACAAGTCTGAAAGGGATAAAGAGAGGAGCAGGAGGGAAAAAAAGATGGAATGTGATCAAGACCTATATTTCTTTTAGTGTTCGTGGCCTATATATTGTATCGGACTCATACAGTTCAGAGCCCAGAGATCTACAGGTAGATACCCTAGATACGGCTTATGTCACGGCCGAATATCATCGTGGTCAGCCAGTTGATAGCCACATAGAGCCTATTTCTCCAGCTGACAACACGAGTCAGGTACGCTGAGCGCCAGATGAACCAGCTTGCAAATCCTGCGATGGATATGCCCTTCGAGTCCTTGCTTTGCCTCAGGTCTACCAGAGCTTTGTACCTTCCAACGGTTGCCATACTCCCTAGATGCTTATACACAAACTTTGGACCTAGATCGACTTCGACCTGGGAGTTTGCGTGCCCTCCTCCAGATTTCATCACACGGTTGAGCAGGCGAGCGAGGTACAAGCCTTGCCGCTCGGCAACCTGTTCAGGAGTACAAGTGGGGAACAAAATCATACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGAGCGCTTTTGGTACTAGTGTAGTGTTAAAAACGCTCTTATATTATGGGACGGGGGGGAGTAGAATGCATGACTGATATGCAGCATCGCAAAGGCTTGAAGGAATCTACCCACATGGCA 0 1 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 4e-22 hvu-MIR1120 0.0000000003 -52.6 .......((.(((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((...))))))))))).))))))))))))))))))).))))))))))))....... (-52.6)