mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTCCGTCCTAAAATAAGTGT ACTTATTTTGGACGGAGGGA GAATGCTACTCCCTCCGTCCTAAAATAAGTGTCTCAACTTTGTACTAACTTTAGTACAAAGTTGTACTAAAGTTGAGACACTTATTTTGGACGGAGGGAGCGGAGGG CCACGCGTCCGCTTAAGCAGGTGGTTGAGCATCCTCACTCCTCAGTGGCCGGCTCTGTCATATGACATCTTCGGAATATGATATGATAGGTTATTTTAGCAAGGTTCGGTCAGATTATTCATATTCCCATTTCTTTTTGGCAGGTTGAACATTAGAGAGATGCTAACAAAATTTTATGCAGGACTTCTTATGGTATTAACTTTGACCTACTAAAAGTCCTTGAATGCTACTCCCTCCGTCCTAAAATAAGTGTCTCAACTTTGTACTAACTTTAGTACAAAGTTGTACTAAAGTTGAGACACTTATTTTGGACGGAGGGAGCGGAGGGAGTACATCTTTTGCATTATTGGCCGAGTGAATTGTGTGTGCATGTCTTGCATTCTCGGATACATTCTGCTGTCGATTATTGTACTATTCGACATTTTGACGTCATT 0 1 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 1e-31 tae-MIR1137 0.00000000009 -58.2 .....((.((((((((((((.((((((((((((((((((((((((.((((((.....)))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).)).... (-58.2)