mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTCCCTCCGTCCCATAATAT ATTTTGGGACAGGGAGTAG AACAAACACTTACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGAACGTTTTTGACACTAATGTAGTGTTAAAAACGTTCTTATATTTTGGGACAGGGAGTAGTTTCTAGC CCACGCGTCCGCAAGAAATGAGACCGTTTCCTGTCATACACGTTACGGTTACGTTGACCGTCTCCATGGAAGAAGAGTACTTCTGAGAGGAACAAACACTTACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGAACGTTTTTGACACTAATGTAGTGTTAAAAACGTTCTTATATTTTGGGACAGGGAGTAGTTTCTAGCATTCCTGACCCGAAAGCAACAAAGACGCCCTTTGCTACTGTGAACCGTTTGTGCGCTTTTTCAAGTGAACCCGCCAGCCACTATTGCTCTGCGTAGCTTATAATGTCTGGGCGGTTATGTGGTGATTATGCTGGCTGTTTCATGCTCATGTTGGCTTGTTCCTTTTGTGCTACGCATTTCATTGGTGCTGTGAGTTCGCTTGAGACATTGCTT 1 2 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 4e-25 tae-MIR1120 0.000000000000005 -51.2 .........(((((((((..((((((.((((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))........ (-51.2)