mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTCCCTCCATCCCATAATAT ATTATGGGACGGAGGGAGTAG TAAAATTATATACTCCCTCCATCCCATAATATAAGAGCGGTTTTTACAGCGGTTTTGACACTACAAAAAATGCTCTTATATTATGGGACGGAGGGAGTAGCATACTGC TTTTTTTTTTAGCATTTTAACTGTAGGNCTATTTAAAAGTAACACCATTTTTGTACTGCTGTATTTTCAACTTCTCTCTACAAGCTGAACTGACATTGCTCCGTGGAAAAGAATGAGTTGATTTGCATCGCACAAAACATAACGCTCACAGGCAGGATGCAAACAATGAACTTACATCGTGCTAAAATTATATACTCCCTCCATCCCATAATATAAGAGCGGTTTTTACAGCGGTTTTGACACTACAAAAAATGCTCTTATATTATGGGACGGAGGGAGTAGCATACTGCTCAAAGTCTGTAACCAGTCATTAAATAGGCATGCCCATTAAATGAGTTCCAACCATACCCTCCTTTCAACTCTCAGTGACTCTGCAGTCTAACAGACGGACACAACACGACGATTGCAAGTTTGCAACACCCTTTCCGTTAGCTAATGGCTTTCTGCGCCAAGAACATCCATTGTGGCAGCCAATTCACCTGCAAACTATTCTTAAGGCTTGATCCTTGCAGGATGACTGGTTTGAACCCCTGGGCTTCGGAAATCCTTGCATTTGGTACTCCAGGGAAGACATAGCTGCATTCTATTAAGTACATACACTTGCCTCCAGTTTGCACATTCCTTTTGTTTATACCTATGATGCGCCTCTGCATTATCCAGCCCTCAAATTCAATATTTCCTTGGCAGTCCTCTGACGAAAATAAGGCATGTGTTTCTGCCCAAAAGTAAGGCCCATATCTCTGCTGTGGAAGTCAATGTATTTGAGCATGAACATGCCACAATCCCATCCATTCTCCTGCAGAGGAAGGTTTTGGACTCCTTCATGCTTCCATGAAAGAACATCAATCTGTTTGC 1 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 0.000000000002 tae-MIR1120 0.0000000003 -46.4 ..........((((((((((.((((((((((((((((((.(((((..((..((....)).))..))))).)))))))))))))))))).))))))))))(((...))) (-46.4)