mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGGTACATCCGTATCTAGAC CTAGATATGGATGTATCTAAC TCCACTTTGTCTAGATATGGATGTATCTAACCAACAAATGCATCTAGGTACATCCGTATCTAGACAAAGTAGAGTCATTTAATT TCCACTTTGTCTAGATATGGATGTATCTAACCAACAAATGCATCTAGGTACATCCGTATCTAGACAAAGTAGAGTCATTTAATTTGGATCGGAGGGAGTAGGAATTTTGTGTAAAAGAAATTCCAAAGACGACCGTATATAAAAGATTATCATTGATATTTGAGATTTGTGGAAGTTAAGATATATGTAGGGTAGAAATCTTAAATGTTAGAAAGTTTAGTGTTAAATCTTATTGAAACTTACTCAAATATTCCATATTTGGATTTTATTTAGAGTAATGATCAGCCAAGATTTTGGGGGATACAATGAATTCGTAAAGATATTGTTCCAAATATGGCATGCTGGCAGGCTCATGATTCTCTTGGTTAAGCATATGGCCTTTTATTTCAAAAGTTAAATATTCTTTGCTTCATGAGATAAAATATTTTTTGTGTTTCTTGCATGATGCATGAGTTCCTCTGTTTTGGTAGTTGTTGGATCAAGTGTTAGCATTTGGAGAG 0 0 3' arm Festuca_arundinacea mirnest MIR1122 0.000004 bdi-MIR5164 0.00002 -36.6 ((.((((((((((((((((((((((((((...............)))))))))))))))))))))))))).))........... (-36.6)