mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTCCCTCCGTTCCATAATAT ATTATGGGACGGAGGGAGTAG GTTACTCCCTCCGTTCCATAATATAAGAGTGTTTTTGACACTAGTGTGTGTAAAAAACACTCTTATATTATGGGACGGAGGGAGTAG GTACATGGGACATGGAAACATCCCTCAAAGGCAAATCATTTCAGAAGAAGCAACTCGGGCGAGAACTTTAGCGGTTTCATGTTTGTTACTCCCTCCGTTCCATAATATAAGAGTGTTTTTGACACTAGTGTGTGTAAAAAACACTCTTATATTATGGGACGGAGGGAGTAGTTAGGAGGATTCAGGAGAAACTTGCTAACTGAACACACATACCTCACAGTCACATTTGTTTGCATTTACCTTTTTGTCGTACAAAAGAAGCACCAGAAGCGTGCTTAACAGTGACACATGTATTACGGAATTCTTGTCCGTCTTGTAGAATGTTTGCTATGCTGTGGAATAAGATTGTATTTGCCTGCTCCTCTCCAATGGTCTCTGTTGGCCAATAGAAAAGTTCTGAATTCCTTATCAAGTATTGGGTCCGAAGCAAAACCATTTGCCTTCATTTCATCATAATACTCTAAAGCTCGTGGTATGCATCCATGTTTAACCAAACCTTGGACCACTGCCATGTAGTGTGCATAACCAGGCCTAATGTCGTATCTTCGCATTTCAGTCCACACCCTCAGAGCATTCCCAGACTCATTCAATTGGATAAACTTATCAATGAGCATGAGAAATGTGTCGCTGTTAGGGCCACAGCCATCTTCTTTCATTTTCTTCAGTAGCTGCAGTGTTTCGTCAATGCCTTCCCTGTTTCAAAAAATGCATGGNACGTCGAAATGGNTGG 0 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 2e-23 hvu-MIR1120 7e-17 -57 ..((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((......)))).)))))))))))))))))))))))))))))))))). (-57)