mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTCCCTCCGTCCCATAATAT ATTTTGGGACGGAGGTAGT TACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGAGCGTTTTTGACACTAGTGTAGTGTCAAAAACACTCTTATATTTTGGGACGGAGGTAGT TACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGAGCGTTTTTGACACTAGTGTAGTGTCAAAAACACTCTTATATTTTGGGACGGAGGTAGTAGAACATATCAAAACAATAGGCAAACCACAAAGGGTGATTTGGTGGAATATGTATCCTGGTTACTACAAGAAATCACTCAAGCATGCTCGTGCCTGCAGCCCTCAGTGGCGAGACAAAGGATTCAGCCATGGGAAGCGTTCTTGCCAAGTACATATTGTTGGATCTTGTGGCTCCTCTGTTGCACCATGGAATCGGCTTGACAAGCAGCGCACGTTGAACAGCGACAAGCATGGCTAATGACACAACCTAACCCTATTGGTCAGCTCTCCGTGAACACATAGGTTCCTATCACATTTATCCAGACCAAGAGAGAACTACATAGAGGTTTGACTGAGCGAGATGGGGTTGACGGACAAGAAGAGGAACCAGAGGGGTGTGCTCTTGCGGTGCTTGGCTTGTTCCAAGACCATGAGGGGAAGGACTTGCTGGTGCGTGCTATGAATTGTTTTTGGTATATCTGTCTTTGAACAGGGATGGAACAATGAGAGGATCAGTGGCGATATTCGAAGAGTTTAAACGGTGTGGTTTGAGGATATCCATTACAGGGATCCCAAAAAACTTGGACAACGAAATCAACATTATAGACAAGGCATTTGGGTTTCAAACCGCATTGGAGAGTGCTCAGTAGGAAATCGATGCGACACATGTGGGGTTGTGATA 2 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 6e-30 tae-MIR1120 7e-20 -51.4 .(((.(((((((((((.((((((((((.(((((((((((((...))))))))))))).)))))))))).))))))))))).))) (-51.4)