mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACATTATGGAACGGAGGGAGT TCCCTCCGTCCCATAATGTAA ATAATCACTCCCTCCGTCCCATAATGTAAGACGTTTTTTGTCAAAAAACGTCTTACATTATGGAACGGAGGGAGTACAAC TTTTTTTTTTGTTTATGATGAAAACACCAACGCCAGGAAATGGAGCTTCGACAGTCAGCTGGGTAAGTACATGGAACTGATACAGCACGATTCACCACACATTGCACAAAATTTATCATAGCCAAAGTGAATTGTACATTTGGGATCTCACTGCTTCACGATTTGAAATAATCACTCCCTCCGTCCCATAATGTAAGACGTTTTTTGTCAAAAAACGTCTTACATTATGGAACGGAGGGAGTACAACTTAGCAATTGTATCTCCAGTTCTCTGTCGTGTGCTCAAGAGTACGTCAAGAAGGGCTAGAACATATATAACGGTTTACAGTATGATATGGCCCGCTGTTCGCTAAGAGCACATTGCTTTCTCAAGCGTCTCCTGCAGTTCTCCGCTCTTGTATGCTTCGAGGGTGATGTCGCAGCCGCCGAAGAACCCGCCGTCGATGTAGAGCTGGGGGAAGGTGGGCCAGCGGGAGTAGTCCTTGAGCCCCTGG 1 0 3' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 0.000000000005 tae-MIR1130 0.00000002 -48.1 ......(((((((((((.(((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))).)))))))))))..... (-48.1)