mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGTCGTCATCATCATCATCC GTGGTGGTGGTGGCGGCATGC TAATATCGTCGTCGTCGTCATCATCATCATCCCCGTAATCCATAAGCTTCAGCAGAGTATCAGAAACTGATGCACTACTTGGTTTTTCTTCTTTAGTCTCCTTTGAAGAAGGTAATTGAGCTGACAAAACCTTTGGTGGCGAGACAGAGCTCGCGCCCAAGGACTTCAGAGGCACCATAGGCTCCTTTAAATCTGATGAATACCTATTTTCATTTCGTAACACTTCAATTGACGGGAACTTGGGTGGTGGTGGAGGCATGTTCCTGGGAGGTGGGGGTGGCATGTCCTTCGAATAAGGTGGTGACAAGTTCTTGGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGCATGCTAGTGGAT GCCGAGGTAACAGCAAACTCATTTTCATACAGACCAAAACGGTTTCTGCCCTGAACTGGGAGTTGGGGTCCCTCCAGGTACGCTGTTATCCGTCTCAATAATATCGTCGTCGTCGTCATCATCATCATCCCCGTAATCCATAAGCTTCAGCAGAGTATCAGAAACTGATGCACTACTTGGTTTTTCTTCTTTAGTCTCCTTTGAAGAAGGTAATTGAGCTGACAAAACCTTTGGTGGCGAGACAGAGCTCGCGCCCAAGGACTTCAGAGGCACCATAGGCTCCTTTAAATCTGATGAATACCTATTTTCATTTCGTAACACTTCAATTGACGGGAACTTGGGTGGTGGTGGAGGCATGTTCCTGGGAGGTGGGGGTGGCATGTCCTTCGAATAAGGTGGTGACAAGTTCTTGGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGCATGCTAGTGGATATATACATATGCGATGGCCTATGCTGTGGGTCTTGTGG 3 0 5' arm Festuca_arundinacea mirnest mir-598 0.000001 100 -93.9 .............((((((((((((((((((.(((.........(((((.((.((.(((((((...))))))).)).)).((((..((((((((((......)))))))))).)))))))))...........)))..(((((......)))))((((((((((((......((((((..(((((.......(((.....((((((..(((....(((.............))).)))..)))))).))).))).)).(((((..((((.(((.......))).))))..)))))..))))))..))))))))))))))))))))))))))))))............ (-93.9)