mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTCCCTCCGTCCGAAAAAA TTTTCGGACGGAGGGAGTATT ATAAGCATATACGGACTATATAAAAGAGTCCTACTCCCTCCGTCCGAAAAAACTCATCCCTACTTTATCTCTCAAATGGATGTATCTAGCACTAACTTTGTGTTAGATTCATCCATTTGATGGACAAGTTTTTTCGGACGGAGGGAGTATTTGTTAGGGACCTACGGATCAATTTTGGA ACCCCAAACCATTGAAGATAGTCTCTCGTACTCAAAACATTGTGGAAAATTTATCAACATACCCAGCAAATTTATACATATGGTCCAATATGAACAAAAATTCATAAGGAAACTTAATCAGAATCAGAGCTCAAACTTTTTGCAGTAATTCATAATCATGTTAAACATTATACGTACAAAATTTCAAGAAATATGATGCACCATATCTACTACTTTGGGCTCCGTGTAAGGTAACTCATTAATATGTCTTATCGTATTCATCTTAAAAACTCAATAGAGCATTTTACATCGTGCATCTTGAATATGTCTTTTTTGGATAAAGTCCACAAGGAGGCTGTTGGAAACTATAAGCATATACGGACTATATAAAAGAGTCCTACTCCCTCCGTCCGAAAAAACTCATCCCTACTTTATCTCTCAAATGGATGTATCTAGCACTAACTTTGTGTTAGATTCATCCATTTGATGGACAAGTTTTTTCGGACGGAGGGAGTATTTGTTAGGGACCTACGGATCAATTTTGGATAAGTCCTAGTTTTTACAATAAGATGAGCGACATGGTGTGATAATATAGAAGTATAGAAAATAGAATAACGTAAAAAAGCATAGCATGCTGCTTATATTTCTATATAAGATATATACATCAAATTGNTTTCCATTAAATCATACATCTTTTGCTATTTTCTACGA 1 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 2e-28 tae-MIR1133 0.000000000000003 -72.3 ............(((((.........))))).((((((((((((((((((((((...........(.(((.(((((((((((.(((((((((.......))))))))).))))))))))).))).)))))))))))))))))))))))............((...)).(((....))). (-72.3)