mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTGCAAGGTGCCAAGCATG GATCTAATCAAGGTTGTGCTGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACACATGTAGCCCAACCCAAGAATGTGGTTGCCTGCTGTGGGTGGCGTGCAAGGTGCCAAGCATGCATATATGTATATGGTCT GGCACGAGGCACACCCGTGCACAGTTCTTCACTTACTCCCCAAATTAACCTAGCTCTATCTTTCTCTCTCCGGTCGTCGTCGTAGTAGTAGTAGTAGCTACCTCCTTGTCTTTTCTTCATGTGTGTCTTGTGCATACCCATCAAGATCTAGCTTTGTTTCTCGCACTAGTCACTACTCACTAATACTCTCGACATACGTAGAGAGAGAGAGAGGGGCATGAATAATCCCTTTGGTTTCCTTGGCCTTTCTTTCTGAACTATTTGCCTATTTGGTGAACAAGAGAGAGGTTTGATGATCGATCTAATCAAGGTTGTGCTGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACACATGTAGCCCAACCCAAGAATGTGGTTGCCTGCTGTGGGTGGCGTGCAAGGTGCCAAGCATGCATATATGTATATGGTCTTTCATTCGGTTTTTTCTCATTTGGTTATTTGATGTGTTTTCATCCCATACATCCTTTTGATCAGTATTTCGATGTTCTTGCAGTTACAAGTCCGTGGAAAATGATTCAGGTCTTCTCCTCTCGCAGCTAACGATTAGCATGGTCCGATGAAACCA 3 0 5' arm Festuca_arundinacea mirnest mir-160 6e-25 bdi-MIR160c 9e-39 -45.8 ((((..........(((((.((((.((((.((.((((((((((...((((((.(((((((....)).)))))...)))))).)))))))))).)).)))).))))))))).........)))). (-45.8)