mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACCAAATTTATAGAAAAA TGTTTATAAACTTAGTCAAAG ACTAATAAATACTCCCTCCGTTTTTATTCAGTCTGCATATTAGGTTTGACCGAAGTCAAACTTTGCAAAGTTTGACCAAATTTATAGAAAAATATATAAACATTTACCATAACAAATCTATATGATGTGAAAGTACATTCAATAATGAATCTAGTGGTATTGATTTTTTATTGTATATGTTAATATTTTTGTTTATAAACTTAGTCAAAGTTTACAAAGCTTGACTTTGACCAAAGCTAATATGCGGACTAAATAAAAACGGAGGGAGTACTATCATA AATGCGAGTTCTCTGCTGTAATATACATGGTAAAAACACAAAATGAGAGAAGGTTACGGGCTTACATAAATAGGTTACAGATTACACATATGCAACAGTCGTCCTCAGAGCTACTAATAAATACTCCCTCCGTTTTTATTCAGTCTGCATATTAGGTTTGACCGAAGTCAAACTTTGCAAAGTTTGACCAAATTTATAGAAAAATATATAAACATTTACCATAACAAATCTATATGATGTGAAAGTACATTCAATAATGAATCTAGTGGTATTGATTTTTTATTGTATATGTTAATATTTTTGTTTATAAACTTAGTCAAAGTTTACAAAGCTTGACTTTGACCAAAGCTAATATGCGGACTAAATAAAAACGGAGGGAGTACTATCATATAGAATTGCACACAATACTTCTATCGTTGCGGATGCAAGATAGCTGCACCTCAAATGTACAGGGGGAATATACATGGATCTGACATGCAACTTGGTTATGAGTCGGGACTCTTTGATGATGGATTGAATGGCACTTGGTCGGCACAATCCAAGTTATCTCCAGAGTGCTGAGCACCAACTCCCATCAAATCAAGATAATGTTGATAGTGGGATATAATGCCATTCATATTATCAATGGACCCTTTACCACAGATGGCATCACCATACAAAATGTTCATTGTCGCACCGAAGCCAGGATACCTCTTGGACAAAGTGTCTTTCTTGGTTGGTTTCCAGTTGCCAACAAAGGCATCATGGGCTGATGGCTGCTTCCTCTT 3 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest 100 sbi-MIR437l 0.00001 -99.8 .........(((((((((((((((((((.((((((((((((((.((((..(((((((((.(((((.(((.((((((.((.((((((((.(((.((((.(((((.(((.((((.(((((.((((.((..((.......((((....))))))..)).)))).))))).)))).))).))))).)))).))).)))))))).)).)))))).))).))))).)))))))))..)))).)))))))))))))).)))))))))))))))))))........ (-99.8)