mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTCCGTCCCAAAATAAGTGG ACTAATTTTAAGACGGAAGGT ATCTTATACTCCCTCCGTCCCAAAATAAGTGGCTCAACTTTGTACTAACTTCAGTACAAAGTTGTACTAAGCTTGAGACACTAATTTTAAGACGGAAGGTGTAGTATT TTTTTTTTTTCGAGGAATATAAGTTTCTTCAATTGCGTTGAACTCTTCATATAACCATATAAGAGCATTTCAAGTTACACAATGACATTTGGCACAAGCACAACTGTACTAGGCTCCATACAGGTACAGCCATGTCATCCTTGTTTATATACCAGGATCACAGTATTATACTATCTTATACTCCCTCCGTCCCAAAATAAGTGGCTCAACTTTGTACTAACTTCAGTACAAAGTTGTACTAAGCTTGAGACACTAATTTTAAGACGGAAGGTGTAGTATTTGACAAACTTTCAGTCTATGATATAGCATACCACGTGGCTGTTGCCTGAAATGAAACAAACAATTTCATAGTATGCACTACAGGACTTTTACCTGAGCAGCTTCGTTAGTAGCATCTTTAATCCATATAGCTATTGTTTCCTGCTTCCCACACACGCTAAGGACCGCTCCACAAATTTCATTACCATATTCGAATTGTCCACCAATCAATGCCAGTAGTGTATCCAACCACAATGGCTGCGATTTCCC 5 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 2e-30 tae-MIR1137 0.0000000003 -33.6 ......(((.((.((((((..(((((.((((.((((((((.((((.(((((.......))))))))).))).))))).)))).)))))..)))))).)).)))..... (-33.6)