mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTAGCTTGGCAATAAAATAT AATTTACTTTCCAGCTAACTGA TATCGTTTAAGATGCTGTGAATATCCCGTTTTCTTAGCTTGGCAATAAAATATTATTCACAGAAACTAGTAATTTACTTTCCAGCTAACTGAAGGGGATATTCAGTGCAA AACAACTTAAACAGAGTCAATTATATAGTTTATGGAAAAGTCGTAAAAATGCCGATACTTGGACAAATGTTTCCTGCAAAGCTGGGTCCCAATTTGATGACAGCCTCCAAAGGGCTAAAAAGTCCTCTTGGCCAGGCGTTAGTCTCCTTTTTGGTTGGTTACTTTGTCACCACAAAGTTGTCGCAATTTTATGGCAAATTCAAAAGGGACTCTGAAAAATCCAATGAGTCAACGCAGAACTTGGACATGTACCCCAGGAAAGAAAGTCAGCCAAAGGACACCAAAGGACACAATATCGTTCTGCTCACTCTGGAGGAGCTAACTGCCTTCAATGGTTCGAGTCCCAGTCTACCCATTTACACCGCTCTGAATGGCCTCATATACAATCTGAGTCCGGGCCAAGAAAAGTTCAGCAGTCACGGTCCGTACTCCCTATTGGCCGGTTGCAATGCCAACAAGGTCCTGAACATTGCCTGCAGTTCCATGGGCGTCTGCGCTGCGAACGTAATAAGTCGCTGGGAGCAAAGCCTAAAAGCCAAATTTAAAGTCGTAGGATATTTAGTCGATGCTGATATAGATATTATTAGCGGTAGTCCAGTCAAACATACAAATTCGGCCATAGGGAAGCAAATGGAGAAGAGTGATATCGTTTAAGATGCTGTGAATATCCCGTTTTCTTAGCTTGGCAATAAAATATTATTCACAGAAACTAGTAATTTACTTTCCAGCTAACTGAAGGGGATATTCAGTGCAA 4 2 5' arm Drosophila_melanogaster mirnest 100 dme-mir-2280 6e-52 -28.7 ............(((..((((((((((.(((..((((((.((.((((((.((((((((...)))..))))).)))).)).))))))))..))).))))))))))..))). (-28.7)