mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAATAATGTTGTTGTTGTAA ACATCTTTAATAGTATTAGCC CGCTACTTGTCTTAATAATGTTGTTGTTGTAATGTCATATCTTGCTAATGTCATGAACATTCTGTCTGGAATTCTTTTATAAATTACATCTTTAATAGTATTAGCCATTGCGGC TTAANATCATTTTAAGTGCCTCGTTGGCACAGTTTTTGGTCATTGCTGATATCGACTCTTTAGTCGCGAATTTGTCAGCATTATCGGCGTCTAATCCGCCGTCTATGTAAGCTGCCTCGAGCTGCTTACGCATACTGTCTATTTCTGTAACGTACTGAGACGCGGTCTTGCCTCTTTGTTGGGCATTTATTAATTTGGCCTTAGCTTTTTCTGTATTTAATACAATTGTATCGTAAAGGCCTTCCCTTTGCGCTACTTGTCTTAATAATGTTGTTGTTGTAATGTCATATCTTGCTAATGTCATGAACATTCTGTCTGGAATTCTTTTATAAATTACATCTTTAATAGTATTAGCCATTGCGGCGGTATAAANAGTTGTATTTGTATAATTATTTTCTAATGATAATTTACTTGAAATTTCGAACATCTTATTTTCTAGTTCTTCTACAAACTTACGAATACTACCACTCCAGTAGGTGTTGTAAAGTCTTCTTAACAACTCTTCGTATGGGATTTGGGTTTTAAATTCATCAATGAAGACTGATCGTAGTTCAGCCCAAGTGTTGCACTGTTGTAACTGGGATACTTCTTGTGCATGTTGGGACAGCTGCCTCTCGAAGGCNCTGTANAATACACTATGTTGCCTCTGGTCTGTTGTCCGGTTTAGGGACATCACAAATCCACC 5 0 5' arm Drosophila_melanogaster mirnest 100 100 -15.3 (((....((..((((((.(((((....((((((......(((.((.(((((.....)))))..))..)))............))))))....))))).)))))).))..))).. (-15.3)