mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGAGCCGTGCCAATATC TGTTGGCATGGTTCAATCAAC TACTGGCTTGGAGAGTGCGATGTTGGCATGGTTCAATCAACAATCGAGTGGTCTCTGCATAGCTTCCTTGCTAGCGTGGTGGCATGCTGCTTTGCTTGATCTGATTGAGCCGTGCCAATATCGCAAGCTTCCTGCCTAG GGCACGAGGCAAGATTTTCGATCTCCTGGGTTTACATTTGGGATATTGGGTCCATGGAAGGAGGCAGGCTGCTATATATATGATGGTGTGTTTAATTCGCATCCCGGAGAGCTAGCTATGCTTGCTTGCTTGCCTCTCCGAGGAGGATTACTGGCTTGGAGAGTGCGATGTTGGCATGGTTCAATCAACAATCGAGTGGTCTCTGCATAGCTTCCTTGCTAGCGTGGTGGCATGCTGCTTTGCTTGATCTGATTGAGCCGTGCCAATATCGCAAGCTTCCTGCCTAGCCCGCGGCCTATGCTGTGAGGAAATACTTGCTTCTTCATAAAGGTTTGAATGCTACATGATTTTTCTTACAGTAGTATTTCCTAGCACGGCATTTCGAAGGAAATTCTCCACCCATTCAGATTTCTTACAAATAATCCTTTCTTTTTCATGTTGTTCCATCAAACAATATTCGGTAAAAAAATCCAGTGATCATGACATTNGCACTACCTGGTTTTATCTATTTATATGCATCTTTAACATCTTGTGTATCAAAGAGGCATACTTANGATCCTTGGTGTGGGCTACCCTCCATTCCTCAGTT 0 0 3' arm Festuca_arundinacea mirnest MIR171_1 0.000000002 far-MIR171 6e-68 -64.1 ....(((..((((..((((((((((((((((((((((((...(((((((((.....((((.(((.((.((....)).)).)))))))....))))))))).))))))))))))))))))))))))...)))).)))... (-64.1)