mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCAGGGACGCAGGGAGGGC CTTTGCTGCGGCGATTTGTTCTT TTGCTTTTACTGCCTTTGCTGCGGCGATTTGTTCTTTCGATTTATGGCAGGGACGCAGGGAGGGCAGGAGCTGGT TTGAGCCACCCACGAGCTGGATAATTTCAATAGTTGCAATAATGACCTCACTGCTGCCCAATTGGGCAAGTGCATTTTCCTTGGATTCCGCGATGCCCACGCCCCACCCCCTCACCACACTCCCGCTCGAATTCCACGACTCCCCACCACATCCCCTCATCGTCAAAGTACCGCGCATAACACCAGCGAGTTTATTATGTCTGCACTTGGGTTTATTTGCTTTTACTGCCTTTGCTGCGGCGATTTGTTCTTTCGATTTATGGCAGGGACGCAGGGAGGGCAGGAGCTGGTGGGAAGTGGGGGCCTGGGGCAAAGGGGCCATGCCCATCGTCTGATTCTTGGCCGTCCTATGCTGTGCAACATTGTTGCAGCCAGTCCGCCAAGTTCGCCAGTGCGAGTGCCAGAGAGCGTATAAAACGTATAAATAAAAGAATTCAAATAAAATTTTTAATAAACGAGTTGCCATTAAATTTATACATTAACTATAATTTTTATAGTTGGCGACTTTGTTTTGTATACGACCGGCGAGAATGGTTTAAGAGGGGGGGTCTATGGGGAGCAGGAAGACGAGGATGTCGTCTTCATGGGACCGGGAAATTTAACGAGGCGTCGGTTCTCCTTTCGACTTCATTGTATTGCTGGGCCGGCGATTTTAATTGTGTTTAGAATTGGCGGCGAATTATTATTAAAGAAATGACGATATC 4 2 3' arm Drosophila_melanogaster mirnest 100 100 -24.8 ..((((...((((((((.(((((....((((((............))))))..))))).)))))))))))).... (-24.8)