mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTCTCAAAGTGGTTGTGAAA TCACAGCCAGCTTTGATGAGCTT ATTGGCGCATTCATGCTGGGCTCTCAAAGTGGTTGTGAAATGCATTTCCGCTTTGCGCGGCATATCACAGCCAGCTTTGATGAGCTTAGCGTAATGTATCGTA GAGTTGATGATTTTTTGTTGATGAAACTAGTAGTTTTGCACATAAGCTGTGTCTAATTTACTTAACTTTTTATAATTAAAAAAAGTGTTTGTTTATTTTAATATGAAAAAACAACTAGATATGCGTGTTGTCATTACATGAGCATGAAAACCAAAATTGAAAATTCTGAACTCCCGCAGTCAAGTATCCCGAAACCTCAATCAATAAAACTATATTGGCGCATTCATGCTGGGCTCTCAAAGTGGTTGTGAAATGCATTTCCGCTTTGCGCGGCATATCACAGCCAGCTTTGATGAGCTTAGCGTAATGTATCGTACATCAAATCATAATAATACCTCCCGCCACATAATTCACACGCCCATCATAAATAAAACACACTATGTCCGCCTCAAATCTGTATAATATTTGTAGTGAAATGCAATCGGAAAATAAACGCGGCTAACAGAGATCTGAATTCGGAACAACGGGGGACAGATGCATGCCACAGCACCGAAAAATGGCTCAACTGGTGGACTGGCACCTCAGACTTAGGGGGCCCTATCGAACTGACTTACACACATGCGGTGCAATATTGTTACTAACCATGTTACTAATTCATAAAGTTAAGGAAACTGTTCCTTACCTGTACGATGTTGATTATCTAAGCCTCATCAAGTGGTTGTGATATGGATACCCAACGCATATCACAGCCAGCTTTGATGAGCTAGGATAATCAACGGGAGACAACGTAAATGAAATTTTAAACCGAAAGTGAATTGGATGTGAAGAAAGGAGTAAAATTTGCTGATTGTAACATAACTACTATTCAAAGCGATCTATTATAGTTTATACTTTTATAAATACATACATATATAATTATGATTTTACGCAGTTTGATTTTCCCCCTTCTGTTGAGTACACAGTTTTAGAGTTAAAAACCATCGATGGTGCTTGGAGACTACTGGCCACTAATGTCTTTCCATCTTCCCCACAGATACACACATCACCCCTAACTCAACGTTTACGTTCCACCAGCAGCATACCTATGTAGAGAAACCCGATTC 1 2 5' arm Drosophila_melanogaster mirnest mir-2 5e-34 dme-mir-2a-1 1e-37 -46.2 ..(((.(((((.((((((((((((((((((((((((((.((((.....(((...)))..)))).))))))))).)))))).)))))))))))))))).))).. (-46.2)