mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTCATGGAATTGCTCTCTTTGT AAAGAGAGCTGTCCGTCGACAGT AAATGCGAATAAGTGAATAAAGAGAGCTGTCCGTCGACAGTCCAGAAACTATTTAATATCACTGTCATGGAATTGCTCTCTTTGTATAATATTCGACGAT AACACCTAGAACGAACCAAATCGAATCCAAATGCGAATAAGTGAATAAAGAGAGCTGTCCGTCGACAGTCCAGAAACTATTTAATATCACTGTCATGGAATTGCTCTCTTTGTATAATATTCGACGATGCGCTGTGAGGCAATGAGACTAACCAAACGACTAAACCCAAGTTCCACATTCAGTTCGTCTGGCCTAACACTGTGTCCTGTCCGTTGAGGTGTTAGCTTAGATTTCCGCTTTCAGATCCTCCGCGAATTGTGAAATGAAGAGAGCTATCCGTCGACAGTCAAGTTAAGACCGATTGTAATACTGTCATGGAATTGCTCTCTTTGTATAACATTCGAAAGGCGACGATTATAAGATCGAATGAATCGAATTGGAGTGCTTAATTTTAAGCCAAACTTGTGAGCGTCCCCCTGGTTATGGTGTCTAATCCCTTCCCACCTTTCAGGGGCTTAC 2 2 3' arm Drosophila_melanogaster mirnest mir-46 0.00008 dme-mir-281-1 5e-46 -32.4 ...((((((((..((.(((((((((((..(((((.((((((...................)))))))))))...))))))))))).)).)))))).)).. (-32.4)