mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCAGCACATCATGGTTTGT AGACCATTCTGAGCTGCCTCT TCTAGATGCTTTGAGGTGATCTAGCAGCACATCATGGTTTGTAGAAACAAGGAGATACAGACCATTCTGAGCTGCCTCTTGACCTCAGAGAAAAGCC TTGGACTGAGAGTTTCTATTTGAAGTGAGAGCCTTTTTATCGAATAAAACCAAGGTTGGTAAGAACCTGCCTGCCATTGGCTGATCAGGTTAAGAACCGGAGCAAATCGAACACTTTAGGAGACCAGTGTTTCTGGCTCTGCTGCCTGAAGAAACGACCAGATTCTAGATGCTTTGAGGTGATCTAGCAGCACATCATGGTTTGTAGAAACAAGGAGATACAGACCATTCTGAGCTGCCTCTTGACCTCAGAGAAAAGCCAAAGCACCCATGGACGCTATATTGCATAAACGCATGCTGGGCTGCACTAATTGCATTTAAACTTAAGTTGCATTAAATGCAAATGGATTTCTAGATGTGTCTGATCAGGATCTGATAACTTTGCTTTGATATTCCCAGTCTTAGAAAAGGAAATTTGTTCTTTACAAGTATATACTTCAAGGGACACTCCCATCTAACTATAATTTTCCCTAGCAGCAGTTTTCACATTTATTTTAACTCTATGGCTGAGAGTTTACAAGAATTAAATATTCTAATATGCTTTGAACATAAATCTAGTCATTTTTGTTTTCCCTTGCAGCATGTGGACATGATTGTACTGCCCCATCTTTTTTCTTCTTTCAGAACGAGGGGTTTTTGAAACAAACTATCTGTTGCTTANATAGTCATTTTGGGGGGTATAGTTTTCCTTTAATATAATCTTAAAGGGCAACTACTTTGTTCCTCTTTCAGAACTAGGGAATAGAAGAGTACGATTTTTCATTATTGCAAAGCCCTTAATATTTTTTTTAAAGGGGCAGCTTATCAAAAAACCAACCAAATTAAGCTTTGGTGTCCATAGAAATTTTAAGGGTTATTGGCCTCAAAGCTTCAATAATTACAAAC 5 0 5' arm Xenopus_laevis mirnest mir-15 4e-22 xla-mir-15c 2e-36 -30.2 ........(((((((((......(((((.((..((((((((((............))))))))))..)).)))))......)))))))))....... (-30.2)