mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTGCACTTGTCCCGGCCTG GGTTGGGATTGGTTGCAATGCT GGACTTGCCCCTTTCTGTATAGGTTGGGATTGGTTGCAATGCTGTACTATTTATGTAGTATTGCACTTGTCCCGGCCTGTTTAGGATGGTTGGGATT GTCTGATCTTCTGGGGCACATTGGGGACTTGCCCCTTTCTGTATAGGTTGGGATTGGTTGCAATGCTGTACTATTTATGTAGTATTGCACTTGTCCCGGCCTGTTTAGGATGGTTGGGATTTTTATCCCCCCTCCCAATGATGCTGGTGTTTTTTGAAGACCCTTTATCATAAAATAAGTTTTTCTTTGCTTTGTGTTTTTAAAAATTTCACTAGACAGTTGAAGTACTTGTGTCTAACTTAGCCATGTATTGCTTGTTCTTAATGAAGATGGAAACACAATCTATTAAATTAATAGAAATCTTAAAACAGTCTCTTGAAAATTTGTACACACAAGGGTCATTTTTGCTACTAATATTGTACAAGTAAGATTGTTCTATACTAAATAACTATTCACAATAACTGACATTTGCAGAAAAGAACCCTGGTTTAGTGATCACTTTTTTATGCAAAAAAAAAACCAGAAATAAANGGCCCCTAAGGCATTTTATTTTTTGANGCTTTTCATGGTACCTTTAGAGCTATCATTTATAGTTGATCTGGAATGCACTTAGTGGTAAAATAAGTAGAACCTCAATTTTACATCCCCTGATTTAGGTTTCCCACGTCTTAACAATTTGTTTGTGGTCCAGCCAATTTGTACTGCATTTTAACAGCTGATTCCGGGATTTTTCATAAAATTTTTTTACTGATTTTTCCATAAA 1 1 3' arm Xenopus_laevis mirnest mir-92 0.00000002 xla-mir-92a-1 7e-39 -38.2 ...((.(((...(((((.((((((((((((.(((.(((((((((...........)))))))))))).)))))))))))).))))).))).)).... (-38.2)