mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGTGTGTGTACATGTACATA TTTATATGTACACACACATAA TTTATAGAAGAATGTGTGTGTACATGTACATATATATATAAATATATATATATATATATATATATTTATTTATATGTACACACACATAAATATGCAC AAAAGGCAGATAGTTCTATGTATAATGAAAACGCCAGCACACCTTAAATAACCAACTATACAGATAAAGAAAACAATTATATGGAATGTCAGCAACATCAAAGAAATGCATGGATTTAATAAATAATATAAAATGAACTCTTGTTAAAATATAAATCTTGTTCTATGCCTAGCAGAACTACCTTCATTTACCAAAATACAGCCGAGTCCATAATGATTTGTTTGAAACAAAAGAAATGAATATGCACAATGTATTTTTTCTTTTTTTTTTTTATCTTATATGGCGGAATAGTTTCTACATGACGGTGGATGTAATATGTACATTGTTATGCAATAGAGAGATACCACAACACATGAATGATTTCAATGAGCACAAGTTAAATAAATTGGGGCTCTGTTGGGGGCACAGAAGCTTCCAGCTAATCGGAATCCAGGAAGCAATGATACAATGCATGGCCTCTCCATCCTTTAGCATGCAACAGAACAAGTCTACATTGTTTTATAGAAGAATGTGTGTGTACATGTACATATATATATAAATATATATATATATATATATATATTTATTTATATGTACACACACATAAATATGCACACTGGGGATACTCAACTCTTCCCACATACTAAGTTAAAAGATAAATACAGTAGCAATAACCATGTCTTGCTTCTTTTACTACCCCACCCAACTTAAAGGGTAATATGGGCCTGCCAAAACACTGGTACCCTAGGAGGAGGAAAATAAATTAAATAGCTTGCTTGTTAGGTAAAATATGCTTGCAAGCCCATTGCCATTGCTTGCAAGGATTGAAGGAAGGTTAGTTCTGTACGGATTGGCACTATAGCAGCCCCATTGACCAATATACGTCTGCGGTTCTGGGCATGGACACATTCTTGAAAATTTCTGCTGAAATTGTTTTCCTACATCTACCAACATACCAATGGACCGCCTAGTGCATTATGATAAGTATTGGCCTCTCTCATCAATAGGTAACATACG 1 0 5' arm Xenopus_laevis mirnest 100 100 -32.8 ...........(((((((((((((((((.(((.(((((((.((((((....)))))).))))))).))).))))))))))))))))).......... (-32.8)