mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTTCCTGCTGAACTGAGCCAG GTTATCAGCTCAGTAGGCACTG TCTCTAGAGGGCCTAACTCCGGTTCCTGCTGAACTGAGCCAGTACTTGTTTCAGGTAAAACTGTTATCAGCTCAGTAGGCACTGGAGGTTGAGCCCAAGCAG TTTTTTCTATTATTTATTGCAATAATGGTCGGATCGCTCTAACAACAGACATAATCTCAGTAGGCCTCTTGGTACAATGAAAGTAAATAAAACAATATTGTATTATTTTATTTTGCAAACAAATATTTAAACATTTATTAGATTTTTACCAAAAAGGCTTTTCTGTGCATGGAATCATTTATTTCTACATATCCTTCTCACGCACTGATGAAGACCTCTTAGTGCCCAATATTAGGGCACACGGGGATTTCAAAGGTCAAATATTTTGGGATGTCTCTGCAGCCTCAGATGTGGTGAATACAACTGGAAAAACTCTGCTCCTGTGATGTTTTAGCATGAACAAACCAACAAGAGCAGATTTCCTCCATCACAAAGATCCCACGCAATGCCCAGTTCCAGAGAGGAAAGGGTTAAAAATTCCTCTCCTCTGACGGACCGATGATTGCGCCACGCTCTGATGGCTTCCTGTTGAATAGCCCTGATGAGGATTTGTGGGGGAAAAGTCCAACCTGTTCTTGGAGCGGTGAGCTTCGTTGCTATACATTCTGACGGATTGTTGTCTTACTAGGACAGGTGATCTTGGTTGCCGGCGTCTCTAGAGGGCCTAACTCCGGTTCCTGCTGAACTGAGCCAGTACTTGTTTCAGGTAAAACTGTTATCAGCTCAGTAGGCACTGGAGGTTGAGCCCAAGCAGCAGCACTGCACTGCTTTCACCACAAGAACCTACTGCAAACATGAAATTGTATGGTCAAAATTGTGTAAAAT 4 1 5' arm Oryzias_latipes mirnest mir-24 2e-33 oan-mir-24 0.00000008 -42.2 ........((((.((((((((((.((((((((.((((..(((((((((...)))))...))))...)))).)))))))).)))))).)))).))))...... (-42.2)