mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCTATGCATATACTTCT AGGCATAAGGCATGGGAAAA CGCTGTTCCTTTTTCCTATGCATATACTTCTTTGACATGTAACTTTAAAGAGGCATAAGGCATGGGAAAATGGGGCTGC TCGGGAGACATGGGTCTGGACGCAGACAGGTGAGTCCTCTTCGTGACTTTTGCAAACCAGTTCTTTTAGTTTAAATAACATTTGTATAAACGTACAAAACTTGTTTTATAAACGGATGATAGGTTTCTACAATTGCAACCAGTCAATGCACATGATTTTTTACAAAATGAGAAAAACATTGGAGATGTTTGTGGAACTCTGATCCTTCTTTTTCAATCCCAGCCTGCAGGTCCCAGCATGCAGTGAGGCAGCAGCGGCCGTTGCACTCGCTGTTCCTTTTTCCTATGCATATACTTCTTTGACATGTAACTTTAAAGAGGCATAAGGCATGGGAAAATGGGGCTGCAGAGGTTTTCCACAGAGCGGACCAAAGCGCCTGCAGACTCTGAGCACCGCTGTCCTGCTCACATCACAGAGGAGAAAGTACAGAATAAGACTCAAAGGTGATTTATCCTTTGTGGTGATTCATTAATTTGATATTTTTAATGTAATGAATCAGTTAAATCTTCAGGCATTGCAAATACTGACATATATGTTTTATTATTGTCATATTTGTTTTTTTCTCTGATCTTTTCATTAATAAAAACATGTTTTTGATTATAANAAANAAA 2 1 5' arm Oryzias_latipes mirnest mir-202 2e-38 dre-mir-202 1e-24 -30.7 .((.(((((.(((((((((((.(((.(((((((((.........))))))))).)))..))))))))))).))))).)) (-30.7)