mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAGGCATAAGGCATGGGAAA TCCTATGCATATACTTCTTT GCTGTTCCTTTTTCCTATGCATATACTTCTTTGACATGTAACTTTAAAGAGGCATAAGGCATGGGAAAATGGGGCTG TCGGGAGACATGGGTCTGGACGCAGACAGGTGAGTCCTCTTCGTGACTTTTGCAAACCAGTTCTTTTAGTTTAAATAACATTTGTATAAACGTACAAAACTTGTTTTATAAACGGATGATAGGTTTCTACAATTGCAACCAGTCAATGCACATGATTTTTTACAAAATGAGAAAAACATTGGAGATGTTTGTGGAACTCTGATCCTTCTTTTTCAATCCCAGCCTGCAGGTCCCAGCATGCAGTGAGGCAGCAGCGGCCGTTGCACTCGCTGTTCCTTTTTCCTATGCATATACTTCTTTGACATGTAACTTTAAAGAGGCATAAGGCATGGGAAAATGGGGCTGCAGAGGTTTTCCACAGAGCGGACCAAAGCGCCTGCAGACTCTGAGCACCGCTGTCCTGCTCACATCACAGAGGAGAAAGTACAGAATAAGACTCAAAGGTGATTTATCCTTTGTGGTGATTCATTAATTTGATATTTTTAATGTAATGAATCAGTTAAATCTTCAGGCATTGCAAATACTGACATATATGTTTTATTATTGTCATATTTGTTTTTTTCTCTGATCTTTTCATTAATAAAAACATGTTTTTGATTATAANAAANAAA 2 1 3' arm Oryzias_latipes mirnest mir-202 4e-37 dre-mir-202 1e-24 -29 ...(((((.(((((((((((.(((.(((((((((.........))))))))).)))..))))))))))).))))).. (-29)