mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCAGTGGAGCTGCTGTTATTT GTAACAGCATCTCCATATGGAA GTTTCTGTGCATCTCACCAGCTGTAACAGCATCTCCATATGGAAAGACTCAGGCTTCCAGTGGAGCTGCTGTTATTTGTGGCGGGACGCCTCTCTT GATTCACTCACAAGTGTCTCTTGCCGTTCATCCCTCTTACTTCAGCAGATCTTCCTTTAGTGGATTTCTATTTATCATCCGGCCATGAATTTTCCTTTTTCTGGCTTTTCTATCTGTTTTATCCGTCTCTGACTGTCCATTTGCTTTCACATGATCAACATTCTTGATAAAGGTTAAACCTTGCCAGAATACCTTCAACAAAGTGGAAAACTAAGGTGTGGCTGCAGTCATTCCAGGATTTATGTACAAAGTATTAACGTGCAACTTCTTTCCAAGAGATGGCAGCATTTGTTCACTTAGATAAACAGAAACTTTTGTGCTAGAAATTGGATTAAATATAAAATCCTTAAATAAAGAAAAAGGAGAATATTTTAGATAATTCTGAACTGTCAGCTGCTTTGAGTTGGAAAAAAAAACAACTTACTGTGTTTTGTTTCTCTATAGAATTCAGCAGAAGACTGTGTCTTTCCTGAGACTGAATTTTCATGACTGTGCTGGGTCCTGTCAGCTGTTTTGTTTCTGTGCATCTCACCAGCTGTAACAGCATCTCCATATGGAAAGACTCAGGCTTCCAGTGGAGCTGCTGTTATTTGTGGCGGGACGCCTCTCTTCAGCAGACTCTGCAGCATGTGCTCAGTAACACTTGTTTTAAGAAATTCTGAGCTAGTAAAAAAATAAAGCACAACTTGTGAATCTCAAAAAA 3 1 3' arm Oryzias_latipes mirnest mir-194 8e-42 oan-mir-194-2 0.00007 -33.1 ........((.((((.(((.(.(((((((((.((((((.(((((..........))))))))))).)))))))))..)))).)))).))....... (-33.1)