mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCTTCATTCCACCGGAGTCT ATTTCAGTGGTGTGAAGTGTA AGGAATATTCCATGTTTTCTGTCCTTCATTCCACCGGAGTCTGTGCCTGTATGGAACCAGATTTCAGTGGTGTGAAGTGTAAAAGACATGGGGATAAAA CGCTGGTAAGTTTTTATGTAACAGTTAAATGTATTTTAATCTTTCTTTTTTTTCAAGATCAGCAGCCAGTTTTAGCAACAAACTGGATTTTTTTAATGAAAAAAATCACCTTAAAATCATAGAAAAAGATGGAAAACTGATCAGAAAGGTGTAAGAGGGAAGCAGCATGTCGTGTTTGCCCGTGAGCAGGACTCTGAGGCGGGCAGACGGCGAGGCTGAAGTTGGACTGGAGCTGAGAAGCGGTGGTATTGCATCACTGATGACTAAACAGTCATTTGGTTCAGACCTGTGACAACATGCCAGAGCCGAAGATTTCAAAAACAGCCGGAAACCCTGGAGCCACGCAGCGGGACAGGCCTGGTCTCGCTCAGCCTCTGACTTCAACCAGTAGGAAAGGGAGAGGCTCTGATCCAAATCTGCTGTGCTCACTGCGTCCGCCTGGGCCCCCGGAGGGTTTCGGATGAATCACAGCCGCATGCTCTGCACCTGGTTGCAGGGCGGGCCATCTCTCCTGGTGCTCAACACAGAAACCTCGAGGCTTTCGTTAAACTGTTTTTCAACATATAAAAAGGCACTTTCCTGCTTCACGCGGAAATCAGGGACCGAATTAAAGTCTGAGTGAGATGGAGATGACAAATGTTTTCTTTTTTGACAATTGGTTTGCTTTATTTCAGGAAACAGCAGGAATATTCCATGTTTTCTGTCCTTCATTCCACCGGAGTCTGTGCCTGTATGGAACCAGATTTCAGTGGTGTGAAGTGTAAAAGACATGGGGATAAAACTTCAGCACAGAGAAACCGGGAAGTTTAAAAAGGATCCCGGATTGTTATTGTCCGTTAGACAAAAGAAACAATTTTAGATTTTTTTAATTTATTTAATTTATTGAGGTTTTTTTGTCAAAAACAGTGATTTTTTTTTAATGTTATCTG 3 0 5' arm Oryzias_latipes mirnest mir-205 6e-49 fru-mir-205 2e-20 -33.5 .......(((((((((((.(((.((((((.((((.((((((((..((.....))...)))))))).)))).)))))).))).)))))))))))...... (-33.5)