mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTCCCTCCGTGCAACAAAA TTTTTGCATGGAGTTAAGATATT CAGTTTGTTTCTTTTTGCATGGAGTTAAGATATTTCATTCACATATTTAAATGATTTTAAGAGGTACATAAGCAATTGAAGAGGAAGACGACGTCCAATGGCCCAACGATTGCTGTCGCGAAGAAGGAAGCTCATGTTTCCGGGTTCCGCCAGGAGCTCCACAAGGAGGTTTCTGGTCGCCTGCCCTATTTACTATGTAGCTAACTTTTACTGCCCTTGCTTTGAAATTGTTTATTTGTAATTCAGTATAGGTGTTGATCTTGGAATACTCCCTCCGTGCAACAAAAGATGTCTCA AATGCAATTTGCAGTTTTTATGCTTGTATAGCTGAATCTCTGCCCATTCTTCGAATATTCGACATGATTTGCTTTTTAATTACTCTCCAAATGTTTTTGCAAGTTAGATTTGGTCTTCATTTATAAATTACCTACTCCATACCTTTGTTATTTGTGGACTAAGTGAATGTCTAATGCAGTGACTTCTCAGTTATGGAATCTCCAGGTGCTGAAACTCAATTTAATGAATCTAAAAAGGCATCGACACGTTCTAGCAAAGAATTGAACTTAGAAGGGATCAGATCAATGGTGGAAATAGTGGCACAAAAGAACATTCAATGGCGTCTCCTTTTGCATGATGTTTTGTTTATAAGCATTGCCATACATATCTTATTTGAACCTTGGGGATCTAAAGGCCTAATATATGTATTTATTTGTGAACAAAGGGGGTGCCAAAGATGTAGTATCAGCAAATAACTGTAAATGCAAGAGATGGGACAAATTGAGGGAGGGCTGGCTGAATGGACACCCTACATGGCTACGAGCTTCCAAAGAGAAATGCCCCTACAGCAGTTTGTTTCTTTTTGCATGGAGTTAAGATATTTCATTCACATATTTAAATGATTTTAAGAGGTACATAAGCAATTGAAGAGGAAGACGACGTCCAATGGCCCAACGATTGCTGTCGCGAAGAAGGAAGCTCATGTTTCCGGGTTCCGCCAGGAGCTCCACAAGGAGGTTTCTGGTCGCCTGCCCTATTTACTATGTAGCTAACTTTTACTGCCCTTGCTTTGAAATTGTTTATTTGTAATTCAGTATAGGTGTTGATCTTGGAATACTCCCTCCGTGCAACAAAAGATGTCTCAACTCTGGTCTAATTTTGGGATAATTTTAGATGTATCTAGACGTGATTTAGTGAACCAAAAAAAAAAAA 4 2 3' arm Festuca_pratensis mirnest MIR1122 0.000005 100 -69.4 .((..(((((.((.((((((((((...((.(((((((.(((.(((((((.((........(((.(((((((((((((..((((.(((..((((..((((.........)))).))))(((.(((((..(((((((((....((((..(((((((((((((....))).)))))))).))...)))).....)).))).))))..)))))..))).))).))))..)))))))))..)))).))).)).))))))))))...)))))))))..)))))))))).)).))))).)).. (-69.4)