mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTGCACTTGTCCCGGCCTG GGTTGGGATCAGTTGCAATGCT CCTTTCTACACAGGTTGGGATCAGTTGCAATGCTGTGCGTTTCTGTGGTATTGCACTTGTCCCGGCCTGTTGAGGTTG GTATCCTACATCAAGGAGTCTGAATGCTTTCTGCTGATTATGGGATGTTTTGTGGCCTTTCTCACTTTTAACAGCAGACTAGTGGATGACAGCTCTTGTAGCACTAAAGTGCTTATAGTGCAGGTAGTGTTCACTAATCTACTGCATTATAAGCACTTAAAGTACTGCTAGCTGTAGAACTACATATTCAGCATGTTTTGCAATTTGTTGTTAAATTGAACACTGTTCTCTGGTTAGTTTTGCAGGTTTGCATCCAGCTGTATGATACTCTGCTGTGCAAATCCATGCAAAACTGACTGTGGCAGTGACAAGTCAGTCAGTAAATGTGGAAAACTTGTACCCCTTTCTACACAGGTTGGGATCAGTTGCAATGCTGTGCGTTTCTGTGGTATTGCACTTGTCCCGGCCTGTTGAGGTTGGTGGGGATAGAGGCTGAAACACTTCATAGTTTTGAGGAATTTCTACCTCCTCATTGATGTAGGAAACCTAAAAACCTTAAGTTTCTCCTTGGAAAAAATGTAATGTAATTTTTGGTGTAACTAGATGTTCATTTTCTGTATCTGAATTGTTTGTATGTACCAGATTTGTTGCTGATAATAATTATTTACTGAAGTCCTTGAGTGTGTGTGGAGGGAGGGAGTTTCATTTGTTCTGGTTTGTTTCTTTTAAGAAAAAAGTTACAAGTCTTCTATTAAACTGGGCCGGAAAATGCGAAAAAA 1 1 3' arm Gallus_gallus mirnest mir-92 4e-37 gga-mir-92 2e-38 -32.6 ((((.....((((((((((((.(((.((((((((..((......))))))))))))).)))))))))))).))))... (-32.6)