mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCGTGCGAGGAGCCAAGCATG TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA ACTTGGGATATGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTCGCGTAGCTGCCAACTCGGTTCACCTCCCACCACCGTAGCGTTGGCTCTACCGCGGATGGCGTGCGAGGAGCCAAGCATGACCATCT AGCTAGCCCGTCCTCTTCCACTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCAGACGCCCACCAACACCACATGCCTCTACGCTCTCTAGACACCTAGCTCCCTCTCCCTCTCCGCAGGCACAACGTGGAATGAGCTCTTCTTGTTTCTTTACTAGCTAGTAGCTCCTTCAAGTGTTCTCGGCTCAGCATTGTAAAGGCTTGCTCGTGAGTGAGTGAGGGTGCGCAATGCAGGTATGCAATGCAGCTTCTGTGGAGCCACTCATGCCGGTAGGTGAAGGTGCGGCAGCAGGAAGAGGTGAAACAACTTGGGATATGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTCGCGTAGCTGCCAACTCGGTTCACCTCCCACCACCGTAGCGTTGGCTCTACCGCGGATGGCGTGCGAGGAGCCAAGCATGACCATCTCTCCCTCCCTACTCCCTCCCTCTCTCTATATCTCTGATTTTGTTTTAGGTTCTTAAAATCCTTAATTGCATCATGCACTGTATGCACAAGCTAAGCTAGCAGGTATATATAGCGATAATGGTAGGGAGTGTTACCGAGATGTAGAGTACGTTTGCCATACTTTACACACTAGCTATTTCATCCCGGATAACGAACAATCATCTGTGCACTAGTTATTCTCTCTCCCTCTGTCCCTATCATCGATTTTGCTTCAGATTTTTTTAAATTACTTGCTTCATGTACTGTATGTACAAGCTAGATAGCAGCTACGTACTGATAATGGTGGGGAGTACTTTCGAGATGTACAGTACCCGTGTACGTACGTTTTGTTCATCTGTCCTTGTGAATGGTAAGTATCTGCAAGCATACAAGATCTGATTTCCGCGTCACTAAACAATCTGTGCACTCGTCGTTAACCTCCTCTCGTTTAAGTTCGTATGCAGTACCTTTCACTATATTATTTGATAACTGGAAACATATATCCCTAACTACGTATTCAGTCGGCCTTTTTGTTCTGCTTCATGAACTACTCAGTCACATTTTTGCCTTGAACTCCAGTAACGTACAGGACGCAGGGGGCAGCACAGAGCACGGCTTCATCGAATTAATCG 2 0 3' arm Festuca_pratensis mirnest mir-160 0.000000000000008 tae-MIR160 8e-27 -57.6 ...(((..(((((.(((((((.(((((((((.((((((((..((((((.((((............))))....)))))).))).))))).))))))))).))))))).))))).)))... (-57.6)