mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCAGGAGAGATGACACTGAC AGGTGTCATCTGGCCTGAACA GGGTGCTCTTCTTGGGGGTTTGGGTCCTGTGCTCAGGAGAGATGACACTGACATCGATCGGATGGATCGGTTTTACTAGGCCATATGTATCCATCCGTTTGGAGTAGGTGTCATCTGGCCTGAACATAGGCCTCACTTACCCAGTAAAAATAGA AATTCAGACAGACAGGCGAAAATACCTTGAGCAGAGCTGGCGAGCACTGGAGCATGGGTGCTCTTCTTGGGGGTTTGGGTCCTGTGCTCAGGAGAGATGACACTGACATCGATCGGATGGATCGGTTTTACTAGGCCATATGTATCCATCCGTTTGGAGTAGGTGTCATCTGGCCTGAACATAGGCCTCACTTACCCAGTAAAAATAGAGTTTCATCTTCATCATACTTGATAGCAGCTTTACAGAAGAAGACCACAAGGTAACTAATGCAGCTGCCTCTTGGGTTTCTTCCTTCGTATTCTCCTCGGTGTTTTTGCCTGTGGTTCAGGAGATGCGGCTGTTCTGACCTGGCAGATTTTGTAGTAAGCAGACGCCGTCGGTTTCCCCCTTTCGATTAGTGTTACCTGCATACAGTTCACCTTGCTCTTGCTATGGCTCTCTGCATCTCTCTCAGGAACACAGACGTACGGCCTTGCTTCAGTGCTGTCATTTGCTACCGCAGGAAAAGGAAGCCGAGCAAATCTAATGAGCTCAGCAGCAACGCCCATTTTGGCTTTTTTGCACGCTTTGAAATCTGAATACGTTCAAGGTCAACCTCTTCTGCAACAAGGGAAGGTTGTTGGTCTGTTAGATGCAACCAGTCGGCCGGGTAGTTTTGCAATATGTTCCGACTTCAACCTAGGTTGTTTTGCGGCTAGTCTTCCTTAAAAAAAAAACACTTCGCACTACCATAAGTTTCTTAGCTCATGTTTTTATTGCAGGGAATTCTTTTTGCTGAAGAGGCGGCAACAACAACGTAGAGCGGCAGTGCCGACTAATGAGAGGTTAGATCCGAGGTACCAATGGAGACAAGAATAGGGAGGGTTAGGCCGCCTCGAGGTGGGGCCACCGGCGCCAGCGAACATCCCATGGTGCCACAGCGGCAGCAGA 4 0 5' arm Festuca_pratensis mirnest 100 osa-MIR1318 0.0000000001 -60.5 (((((((((.....))))).((((.((((((.(((((..((((((((((.((.((((.(((((((((.((((......))))......))))))))).)))).)).))))))))))..))))).)))))).))))...))))............ (-60.5)