mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACAAACAAAGCATTTGTGTT CAGGGATGTTCTCTTGATAAG CACTCCAACACTGACATCATTTACAAACAAAGCATTTGTGTTTAGTGAGTCCGCCAGGCCAGAGGCAATAGGGATGAACAGGGATGTTCTCTTGATAAGTGAGTAAATTGGACCATT GGGGAGAGTAGCTGCTGCTTTTGCAACAACTAATGGGAATCCTAATAAAATAGAAAAAAATACAGAAAAGTACATTTAATTGCTAAAATATGCCTAAATATCAAAAGTAAAAGTATAAATTATTTCCAATTAGACAGCAGAATTTTTTTTTACCAGATAGCCAGGGGCACACTCCAACACTGACATCATTTACAAACAAAGCATTTGTGTTTAGTGAGTCCGCCAGGCCAGAGGCAATAGGGATGAACAGGGATGTTCTCTTGATAAGTGAGTAAATTGGACCATTTTCTTGTCCTGCTAAGTATTCAAAATGTAATGAGTACTTTTGGGTGTCAAGGAAAATGTGTGGAGTAAAAAGTATAATATTTTCTTTAGGAATGTAGTGACGTAAAAGTTGTCCAAAATATAAAAAGTAAATTACAGATGCCTCCAAAAAACGAGTTAAGTAGTACTTCAAAGTATTTTTTTTACTTAAGTACTTACACAACTGAGCAGACATCCCGCTCAAAATAGGCTCTGTATGCCTGTGATAGTGTTGTATAAATAAGAAAATACACACACGCCAATTTTAATTACACTAAAATGTGCAAATTAACCTATAGACCGATAAGCAT 4 2 5' arm Salmo_salar mirnest 100 100 -25.6 ...(((((...((...((((((((((....(((((((.((((((.....(((.....(((...)))....))).)))))).)))))))...))).))))))).))..)))))..... (-25.6)