mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAGGTTGTATAGT TATACAACTTACTGTCTTTCC GGGGTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTTAGGGTCATACCCTTCCTGTCAGATAACTATACAACTTACTGTCTTTCCT GGGGTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTTAGGGTCATACCCTTCCTGTCAGATAACTATACAACTTACTGTCTTTCCTGAGGTGGCTGTAATATCATCCATTATCTCTGCAGAGCTCTCGTCACTTGGACCTCGATAGGAATATGTATTATGTACTAATTCAAGTTGATAACACGTTTGTAATGTCATTTATATTGTATGTTTGCATCATTTGGTTCTGTTCTGGCTCTTTGTATACTGTATTTATTATTTTGCCGTGAAACGGCTCTGCCTCTCTGAT 1 0 5' arm Salmo_salar mirnest let-7 1e-30 tni-let-7a-2 5e-36 -30 .(((.(((((((((((((((((((((..(((((...)))))...........))))))))))))))))))))).))) (-30)