mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAGGTAGTAGATTGAATAGT TATACAATCTACTGTCTTTCC CGCTGGGGGAGGTAGTAGATTGAATAGTTGTGGGGTATATGTCCTCCCTCTGAGATAACTATACAATCTACTGTCTTTCCTAAG CGCTGGGGGAGGTAGTAGATTGAATAGTTGTGGGGTATATGTCCTCCCTCTGAGATAACTATACAATCTACTGTCTTTCCTAAGGAGACAGACTGATCGTCAATAACCCTGAAGATTGACTGTTCTCCCCTGACCGTCCCACCCATCTTCCCAGCCTGGACACCTGCCTGCAGCCTGTCTCTGCTCAGTGGGGAAGTTACGCCATTAGCATATCACCTCCATTTACACCCATTCACAGACTGTTGCAGGACAAAATGAGAACGGGCAACATTTCCTTTGTTAGACCACCCAATGCTTTATTTGTTGTGTTTGAGTAAAAGTGTACTTTAGGGCGATTGTGTTTGTGTTGTCCCCTCTCGCTGTATCTCTTTGAGTGTGTTTGAATGACATTCCCCCTTCATCCATCAGTCTTTCAGGTGAATGTGTCCTGGCGAGGTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTGTGGGAGGGATTTAATCCTATTCAGGTGATAACTATACAGTCTATTGCCTTCCTTGAGAGGCACAATGACCGTCTGCAGCAACGAGGAAGTCCACAGAAAGCTGCTCTCTGAATTCCTCAATGCATTGGATGCAATCTCACTATGATAAAGCAAAAGCTGGAGCACAAATGTGTTTATAGCCTCGCCAGCGCCACTTGGTGGCCAAGGAGCAGCAGGACTCCAGAGACCTTGTAGGTTCACGATTCAGAGCTCCTCAAGAATGAAAGGATATGAAATGCACTCAACAGAGAATGCATCAGTGTTACAAAATCTAAACAATAAGGGTTGGTTCTCCAGAACCAAATCAAGCCCTAAATAAATGCTTTTAGGCTTGTGATATGTTTTAGGGTAACATTATTCAAGGTTTTATTAATTAATAAAGGTTAAATATAGCTATT 1 0 5' arm Salmo_salar mirnest let-7 9e-29 tgu-let-7e 2e-23 -30.3 ...(((((((((((((((((((.((((((((((((..........)))).....)))))))).))))))))))))))))))).. (-30.3)