mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTATACAATCTACTGTCTTTC GAGGTAGTAGATTGAATAGTT CGCTGGGGGAGGTAGTAGATTGAATAGTTGTGGGGTATATGTCCTCCCTCTGAGATAACTATACAATCTACTGTCTTTCCTAAGGAGA CGCTGGGGGAGGTAGTAGATTGAATAGTTGTGGGGTATATGTCCTCCCTCTGAGATAACTATACAATCTACTGTCTTTCCTAAGGAGACAGACTGATCGTCAATAACCCTGAAGATTGACTGTTCTCCCCTGACCGTCCCACCCATCTTCCCAGCCTGGACACCTGCCTGCAGCCTGTCTCTGCTCAGTGGGGAAGTTACGCCATTAGCATATCACCTCCATTTACACCCATTCACAGACTGTTGCAGGACAAAATGAGAACGGGCAACATTTCCTTTGTTAGACCACCCAATGCTTTATTTGTTGTGTTTGAGTAAAAGTGTACTTTAGGGCGATTGTGTTTGTGTTGTCCCCTCTCGCTGTATCTCTTTGAGTGTGTTTGAATGACATTCCCCCTTCATCCATCAGTCTTTCAGGTGAATGTGTCCTGGCGAGGTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTGTGGGAGGGATTTAATCCTATTCAGGTGATAACTATACAGTCTATTGCCTTCCTTGAGAGGCACAATGACCGTCTGCAGCAACGAGGAAGTCCACAGAAAGCTGCTCTCTGAATTCCTCAATGCATTGGATGCAATCTCACTATGATAAAGCAAAAGCTGGAGCACAAATGTGTTTATAGCCTCGCCAGCGCCACTTGGTGGCCAAGGAGCAGCAGGACTCCAGAGACCTTGTAGGTTCACGATTCAGAGCTCCTCAAGAATGAAAGGATATGAAATGCACTCAACAGAGAATGCATCAGTGTTACAAAATCTAAACAATAAGGGTTGGTTCTCCAGAACCAAATCAAGCCCTAAATAAATGCTTTTAGGCTTGTGATATGTTTTAGGGTAACATTATTCAAGGTTTTATTAATTAATAAAGGTTAAATATAGCTATT 1 0 3' arm Salmo_salar mirnest let-7 1e-28 tgu-let-7e 8e-26 -30.3 ...(((((((((((((((((((.((((((((((((..........)))).....)))))))).)))))))))))))))))))...... (-30.3)