mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGTACCGTGAGTAATAATGCA CATTATTACTTTTGGTACGCG TGCTTCACGGTCCATTATTACTTTTGGTACGCGCTCGGCCAGTCTCAAACTCGTACCGTGAGTAATAATGCACTGTGGCTG CGGCAGCGACGGAACAGAAGGGAAATACACATTTGTAGCCTATACGGGGATGAAACCAATATTGGGAGATGGTCGCGATGGCAAAATAGCCCAACAAGTCAGTCAAGTGAATAGAGGTGATGTGGCAGCTGCAACCAGGTAGACTCAAGAGGCTTGGCATTGTGTTCTCCATTCTATGATAGATGGAAGCTACAATCTCACACCCCAACCTCAATGCCCAAGGGAATTTTACAATATTGTACAATGGGATGTAGAGGATAGTTGGCTTCTCATAGCCAGATCAAACCTGGGATTCCCCCCCCCACAGATAAACCGAAGATAAGAGTTTCTGCCTGCTTCACGGTCCATTATTACTTTTGGTACGCGCTCGGCCAGTCTCAAACTCGTACCGTGAGTAATAATGCACTGTGGCTGTCACTGCCAACGAGAGACGGACAGCACCACAGTTCTCCATAATCCTATGCATCTCATCGTTGTATAGCCAGTTGTGAAGCAAGAAATGTGATGAAAACTCAGCCCTTGTCTCAGAATGACAGCATTTGAATATAATAATTTAGGATACTTTCATATCCAGTGAAGAAATTGACTAGCCAGTTAAATATTATTATTGAATTATTTACTTTAAATATGTTGTTGAATGTAACACTGACATTTGAAAATTATAACTCTAAATGGTAAATCTTATTCATACTTGCAAAATAAATTCCCTGTGCCTTGTGACTGTTATATTTATGTTGACTGCATATGTCTTGAAACAGTCAAATTAGGCTATAGCCTATTATTATGTCTTAATTTTTTGTAGGGAATTTTTTTTTGTTCTTCTCAAATATCCCAAAATGTGCCTATAATTGAAT 2 0 3' arm Salmo_salar mirnest mir-126 2e-29 dre-mir-126a 2e-32 -28.4 ....(((((((.(((((((((((.(((((((.((...)).(((.....)))))))))).))))))))))).)))))))... (-28.4)