mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACCTTGGCTTTAGACTGCTTA ACAGTCTACAGTCATGGCTA CCCTGACTGCCAGAGCATCAGCACCTTGGCTTTAGACTGCTTACTGCTTTAAAAAAAAAAGTCTCACAGTTACAGTAACAGTCTACAGTCATGGCTACTGATGCCTGGCAACTCGC AAACATCTTCTCTTCTCTTCTCTTCATTGCAGGTGCAGTGGTATGTAGGCTATCCGACCTGTTCTCTCCCTCCTTCTCCTGGTTACCGTGGTTACGACCCCCTGACTGCCAGAGCATCAGCACCTTGGCTTTAGACTGCTTACTGCTTTAAAAAAAAAAGTCTCACAGTTACAGTAACAGTCTACAGTCATGGCTACTGATGCCTGGCAACTCGCCGTGGCAACACTACCTGTCCTGGAGACATCGCCCTGGAAGTGCGGCTATGGAAACTATAGTTTAGGTTAACTAACACCCTGACAATGGTATTGTACAGATGTCGTCTTAATTTGATCATCCTGTTGTTGCAGGAATTTTCCTTCACAACAGGAAATGTAAATGTGTAGTGTATTTGAAAACGTCAGACTTGATTTGTCCAACAAAAAGAGTGTATCAACCCCTACAACAACAAAAAAATCCATGAATTATAATCCACATAACAATTCACATTTCCTGTTGCTGCAGGATTATTTTCATGCTGTGTGAAACTGGGCAAATTAAGATATGGCATGTCTTGGTAAGTCTCTAGGAATGTCCTCGTCGCAACTTTCCAGAGGACTCCACAAAAACTCCACAACGCTCTCTTCTCCTCTCTCTCTTTCTCCCCCATTTATTCCTCTCTTCCTTGCTCTCCCTCTCTCCCCCCCAAACTCCCTCTTTCTCCTCTTCTCTCTGCCTCGTGCCCCTGTGTGTGAGCCAGCCTGACTGC 3 1 5' arm Salmo_salar mirnest mir-132 5e-19 tni-mir-212 0.0000000000004 -40.4 .......((((((.(((((((..((.(((((.(((((((.((((((..........................))))))))))))).))))).))...)))))))))))))...... (-40.4)