mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAACAGTCTACAGTCATGGCT CCTTGGCTTTAGACTGCTTACT CCTGACTGCCAGAGCATCAGCACCTTGGCTTTAGACTGCTTACTGCTTTAAAAAAAAAAGTCTCACAGTTACAGTAACAGTCTACAGTCATGGCTACTGATGCCTGGCAACTCG AAACATCTTCTCTTCTCTTCTCTTCATTGCAGGTGCAGTGGTATGTAGGCTATCCGACCTGTTCTCTCCCTCCTTCTCCTGGTTACCGTGGTTACGACCCCCTGACTGCCAGAGCATCAGCACCTTGGCTTTAGACTGCTTACTGCTTTAAAAAAAAAAGTCTCACAGTTACAGTAACAGTCTACAGTCATGGCTACTGATGCCTGGCAACTCGCCGTGGCAACACTACCTGTCCTGGAGACATCGCCCTGGAAGTGCGGCTATGGAAACTATAGTTTAGGTTAACTAACACCCTGACAATGGTATTGTACAGATGTCGTCTTAATTTGATCATCCTGTTGTTGCAGGAATTTTCCTTCACAACAGGAAATGTAAATGTGTAGTGTATTTGAAAACGTCAGACTTGATTTGTCCAACAAAAAGAGTGTATCAACCCCTACAACAACAAAAAAATCCATGAATTATAATCCACATAACAATTCACATTTCCTGTTGCTGCAGGATTATTTTCATGCTGTGTGAAACTGGGCAAATTAAGATATGGCATGTCTTGGTAAGTCTCTAGGAATGTCCTCGTCGCAACTTTCCAGAGGACTCCACAAAAACTCCACAACGCTCTCTTCTCCTCTCTCTCTTTCTCCCCCATTTATTCCTCTCTTCCTTGCTCTCCCTCTCTCCCCCCCAAACTCCCTCTTTCTCCTCTTCTCTCTGCCTCGTGCCCCTGTGTGTGAGCCAGCCTGACTGC 4 1 3' arm Salmo_salar mirnest mir-132 5e-19 tni-mir-212 0.0000000000004 -40.4 ......((((((.(((((((..((.(((((.(((((((.((((((..........................))))))))))))).))))).))...)))))))))))))..... (-40.4)