mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCTTATCAGACTGGTGTTG ACAACAGTCTGTAAGCTGTC TCCCTCTCCCATCCTGTCAGATAGCTTATCAGACTGGTGTTGACTGTTTGAATCACATGGCGACAACAGTCTGTAAGCTGTCTGAAGTTCTGGGTATTAA ACATTTAGACGGTCTTTGAGCAGAATATATAAAAATGCCTAAATCATTCTTGTTTCCATGTCTGAGTTTCTCTCTCACTATTTAAACAATTGCCTCCATTCTTGTAAGCTTGCCCCATATTATTGTATATAGAGAGTCTTCTACTGTTGAGGTAATAGTGCTTAGGCACTCATGACCACCAAGATTGAAAAAAAGCTTGAACCTCTTTTAAAGAATTAACATCCAAAAGGTAAGTGCCAAGATTCTCAAAGCATATGGATCGCTATATTGTAAATTGGAGAATAATGTATTTAAAGGAAAATATGGAATTGATATGTTGTAATTTGAAACTAGATATGAGCGAGTTGTATATCATCACAGCTTATTGTCCTGTCGGGAAAATACGTTTTCTGAAGCTGGTTCGTATAGACCTGGTCCTGGCTGTTGCAGGTATTTTACTCCCTCTCCCATCCTGTCAGATAGCTTATCAGACTGGTGTTGACTGTTTGAATCACATGGCGACAACAGTCTGTAAGCTGTCTGAAGTTCTGGGTATTAACCATCTGAAGAGTGCTGCTTGACTATGGT 1 1 5' arm Salmo_salar mirnest mir-21 1e-16 gga-mir-21 9e-17 -38.4 .......((((.....((((((((((((.(((((((.(((((.((((.((...)).))))))))).))))))))))))))))))).....))))...... (-38.4)