mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATACTCCCTCCGTCTCATGAA GATGAGACGCAGGGAGTATAT GATTGTTACTTTTATACTCCCTCCGTCTCATGAAAGATGTCTAAAATTTGTTTAAATTTAGATGTATCTAGACACTAAATAGCATGTAGATACATTTAAATTTTGACAAATCTCAGACATGTTTGATGAGACGCAGGGAGTATATGAAACTGAAT AGATTTCAAGAAATCCATTTCTTTGGGGACAAAACCTACAAGGGTGGCAATGACCATGAGATATTTGAATCTGACAGAACAGTTGGTCATACAGGTATGCTGGTTGTATGTTGAAAGCTAAATACTCTCATGCTTATGAAATCAAGAAGATTTATTTGATTTTAATTAAGCTGTGGGCATCCCCGAGTGAGAAATTTTACATGATAAGAAAAGCCATAGTTTAAGGGGAGATTTTTTAAATGGCTCGAGAATAAATATAAGAGACAGAAAGAACAGATTTGCACAACTGTATAGATTGTTACTTTTATACTCCCTCCGTCTCATGAAAGATGTCTAAAATTTGTTTAAATTTAGATGTATCTAGACACTAAATAGCATGTAGATACATTTAAATTTTGACAAATCTCAGACATGTTTGATGAGACGCAGGGAGTATATGAAACTGAATTTTCTATACTATGTAGAGCATGCAAATAGCACACAAAATTATTAGTTTCATATTTGGCATGGTGATAGTTAATGTTCGCCCCTGCTCAAGCATGAGGGTCTCATCATTAGCATGCAACTTCTCTGAATTTTGACGACCGAGTTGTATTTTGGCTGTGAGAAACTACATTTTCATCATCATATTAGTTCATAAGTTGCATGACATTCTACTCTTTAATCATCCGGATAAGCAAATTTGAGTCTGGAACTAATCAAGTTTTGTTCCGGACAACTGCATATGCCATTTCTTGAGTGGAGTATTGAATAAACAATAGGGCATAAATACTTCTTTAGAAGAAATATTGCATCCCATTGTTATTTAGTTGCTAAGCATTACTTTGTTACTTGGTAGTGATATTAGAGCTGGTGTTGGTTCAGTTTCTTATCTCAGTTCACCGCATGCTTTTTTTTATGCTGACTAATCATTTATATGTGCAGTTACCAGCCCGGACGACACAGTGCAGCAGTGCAGATCTATCTTCTTGTCAAGGTGATTGGCCTGATTATTGTACCATTTATTTTATGTACTTCACACAAAATAGTTGCTCCATAGATTTCCCTTTCAATACATTTTT 2 0 5' arm Festuca_pratensis mirnest MIR1122 0.000002 100 -56.9 ....(((..((.((((((((((.((((((((.(((.((((((...(((((((.(((((((((((((((((................))))))))))))))))).)))))))...)))))).))).)))))))).)))))))))).)))))..... (-56.9)