mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGTAAATGCTTAATAATGAA TATTGTGAGCATTTGCTGAG TCCTACGTAGGTATTGTGAGCATTTGCTGAGAATGTCTTTTCAGCTCAATATCTGGGATACAGTAAATGCTTAATAATGAAGATGATGTC CTTCTGAGAAATTGTGAATATCCATCTCAGATATGTTTATTATGGGTTTTTTTTTAAGAGTTAGCACCCATTTTATCACTGGAAAGGCAGAAGTAACCTCTCAAGGCAGCCAGGGCAGCCTGGGTAGAATACAAATGGAAATCAGAGGGAATCCTACAGGAAGTACAGTGTAAGTGCTGCCTTTGAGCAAACCTTCAGTGTCACTTAGGAAGGGAGCTCCCTAAACCACATTATTTGTGATTGGAGAAGAGCAGGGCTGCAGGGGACACCCCCCTCCACCGCCACCAGGTGCACAGTGGGGGGCACTGTGTGACATCAGGTGCATTGGAACTGGGTACACCACTCCGTGTGGGGTCGGGGGGCCAGCACCGTTCTCCACCTGCCTGCCCCTTTCCATAGAAGTTGTCTAAGGGAACTTCACCAGTAACCTTCTTAGTGCCACCACCAGTCACCCCTCGCAGCTTTGCATAGCACTGTCGTCCCTCAGCAGTGCCTTTCCAGCGTCATATGTGATAGAGAATGATGACCATACCTGTCCTACGTAGGTATTGTGAGCATTTGCTGAGAATGTCTTTTCAGCTCAATATCTGGGATACAGTAAATGCTTAATAATGAAGATGATGTCAAATACTTGTTCTTATGATGAAATGTTTTGGGAAGCTTTTATCAACAGGTTTTTTGTGATGATTGANGTACCATATTTTCAAAAATTAATCTTGTTTTTTTTTTTTCCTTAGAAAAGATAATTGGACAAGTAACGAAACTG 2 1 3' arm Canis_lupus_familiaris mirnest 100 100 -19.7 .....(((...((((((((((((((((((.(((......)))..((((.....))))...)))))))))))).))))))...)))..... (-19.7)