mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGTGGCTCAGTTGGTAGAGTA CTTGATCTCTGGGTCGTAAG AAAAAAAATAAGGGGCACCTGGGTGGCTCAGTTGGTAGAGTATGTGACCCTTGATCTCTGGGTCGTAAGTTTGAACCCCACATTGCA AAGAGCCAGTTAAACCTAACATGAGCTGAAGGAAGGACATAATAAAAAAGTAGAAACCTGTAAAATTGAAAGCAAGAACAATATAAAAAAAAATAAGGGGCACCTGGGTGGCTCAGTTGGTAGAGTATGTGACCCTTGATCTCTGGGTCGTAAGTTTGAACCCCACATTGCACATAAAGTTTACTGTAAAATTTTTTTAGTTTTAATTTTTTTAATAAAGATTTTAAAATCTTTAAAAAATCAAAAGCAACTTATTTGAAAAAATAAAATTTATAAACCTTTCTTCTAGCCATATTGACCAAAACTGCTCCCCGAGACACACAGAAGACAGAAATTACCGACGTCAGTAATTTAAAGACAGGGCACATCACTAAAGAACTTACTGAGAAGATAATGGTAATAAAGGCATATTGCAAACAACTTTATTCAATAAATTCAACAGTTTAGATGACATGGACACATTTTTTTTTTTTTAAGATTTATTTATTTATTCATTC 5 1 5' arm Canis_lupus_familiaris mirnest tRNA 0.000000000000005 100 -16.9 ...........((((...((..(((((((((..(((.(((.........))).))).))))))))).))......))))........ (-16.9)