mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGT TTAGCTTGGTACGAGCTCGGA ACGTTAACTTAGCTTGGTACGAGCTCGGATCCACTAGTCCAGTGTGGTGGGGCGCATGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAAGCAGTGTCTCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGT ACGTTAACTTAGCTTGGTACGAGCTCGGATCCACTAGTCCAGTGTGGTGGGGCGCATGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAAGCAGTGTCTCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAAATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCGATCCAGCACAGTGGCGGCCGCTCGAGTCTAGAGGGCCCGTTTAAACCCGCTGATCAGCCTCGACTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCCCACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGGGTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAAGACAATAGCAGGCATGCTGGGGATGCGGTGGGCTCTATGGCTTCTGAGGCGGAAAGAACCAGCTGGGGCTCTAGGGGGTATCCCCACGCGCCCTGTAGCGGCGCATTAAGCGCGGCGGGTGTGGTGGTTACGCGCAGCGTGACCGCTACACTTGCCAGCGCCCTAGCGCCCGCTCCTTTCGCTTTCTTCCCTTCCTTTCTCGCCACGTTCGCCGGCTTTCCCCGTCAAGCTCTAAATCGGGGGCTCCCTT 3 2 3' arm Canis_lupus_familiaris mirnest 7SK 0.000007 mmu-mir-1935 0.00000000003 -42.9 ..((..(((..(((.(((.(((((((((((((.((...(((...)))((((((((.(((......(((((.....))))).))))))))))))).)))..))))))))))..))))))..)))..))..... (-42.9)