mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGTTTGAGGCCAGCCTGAT TAGCTTGGTACCGAGCTCGGA CTTAGCTTGGTACCGAGCTCGGATCCCTAGTCCAGTGTGGTGGAATTCGGCACGAGGGTGGCGCACGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGTCAGAGGCAGCTGGATTTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGATCTATAAAGT CTTAGCTTGGTACCGAGCTCGGATCCCTAGTCCAGTGTGGTGGAATTCGGCACGAGGGTGGCGCACGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGTCAGAGGCAGCTGGATTTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGATCTATAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCTGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAACCAAAAAATGAATACATAAAATAAAATAAATGTTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCCCCCGGGGGGGGCCCCCCCTTTTTAAGGGGGCCTTTTAAACCCCCAAAAAACCCCCCGGGGGGCCCTTTTTTTGCCCCCCCCTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCGGGTTTTTTTGGGCGGGGGGGGGGGCCCCCCCCCTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCCCCCCTTTTGGGGAGGGGGGTTTTTCTTTTTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCCCCCCCCGGGGGGGGATTTTAAAAAAAAAAACCCCCCCTCGGGGGGAAAGGGGGGGTTTTTTTTTT 4 0 3' arm Canis_lupus_familiaris mirnest Metazoa_SRP 0.000002 mmu-mir-3470b 0.000000000007 -44.9 .((((.(((((..((((((((((.....(((((((((((((....((((...))))....)).)))((((((..(((((.....)))))...)))))).))))))))))))))))))..))))).)))).......... (-44.9)