mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTGGTAAAATGGAACCAAAT TTGGTCCCCTTCAACCAGCTG CAAACTAGCAGCACTGCAATGCTTTGCTAGAGCTGGTAAAATGGAACCAAATCGCCTCTTCAATGGATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTAGCTATGCATTGATTACTACAGGACAG GCGTTTGTGACACAAATGTTAACATGCACAGACTTCTACTCTGTTCAAGTGGGAAATAGTAGGAAAAGTGTCTCAAAATAGAAAAGTTTATATGTAATGACTAAAGAGTACTGTCTCTAATATTTGTAGAAAGTCCATAACCATAACTGTACAAATAAAGAGCATTTCAATTCTTTTGTATCCCAAACTAGCAGCACTGCAATGCTTTGCTAGAGCTGGTAAAATGGAACCAAATCGCCTCTTCAATGGATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTAGCTATGCATTGATTACTACAGGACAGCCAACGTTTCCATTTATGAATTTCATCACATGTTGACTAATTTCAGCTTATTTAAATTATTCAGGCTGTGGTTTAAATCAAATAATTTGTTACTGTTAATTCTCCTTGGGAGAACCATAGTGGTTAACAATGTTTATAAAAGGTTTTATGAAAAATGTGTAGATGACTTAAGGATTGCAAATAAAATATTTTTACTT 4 0 5' arm Canis_lupus_familiaris mirnest mir-133 3e-26 rno-mir-3582 6e-46 -35.4 ................((((((...((((.(((((((..((.((.((((((((............)))))))).)).))..))))))).))))...))))))............... (-35.4)