mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATGGTCGTGATCATGGTTG GTCGTGACTGTGACTATGATC ACCCCTGGATCGTGCACATGGTCATGGTCGTGATCATGGTTGTGACCACACTCAGCAGTATGAACATGATCCTCCTCACACTTATGCGTGTGTTCGTGGTCGTGGTCATGGTCGTGGTCATGGTCGTGACTGTGACTATGATCATGTGCATGTGCATGTGC ATATTCTTATCTAACAAACTCGGGATTCAGGTTTAGCAGATCCCTTCACAAGAAGATCAAGGAATTCTAATTATGAACAACGCATTCCTGAAAACCTTTCCTAAGCGAAGTTTCATCTAGATTCCTGCCGATGAATACAATCTTACTGACCCGTTTCTCATCAGGACCCCAATTCCGTTCTGGAGCACCTTCGAGCAAAGCGTGGACACCCTGAAATACAAATCTTTCGTCCCAACCATCAATTGATAGAACACCCTTTGCCCGATATATTTCCTCACTGCGTTCATCGATAACGCTTTCCAACCAGTTGTTTATCCTGTCAAGATCAAGAGCACCATCACACACTATTGAAACAGAGGAAACCCCTGGATCGTGCACATGGTCATGGTCGTGATCATGGTTGTGACCACACTCAGCAGTATGAACATGATCCTCCTCACACTTATGCGTGTGTTCGTGGTCGTGGTCATGGTCGTGGTCATGGTCGTGACTGTGACTATGATCATGTGCATGTGCATGTGCCTCTGTATGCTCATGGTCCGGGGTCTTCACGCCTTTCAAGATATCGTCTTCAACTCTTTCAAGATCAAAGCCACCTACACCTAGGACATAATCCAGGTCCACCTCAGCCTTCTTCGCCTTGCGCACTTGAGCTAGCCCATNGATGCGCTTTATTCGCCGCATCATCGACTCCACCTCAGATTCTTTAACAAGATCGATCTGGTTCNAAATAATGCG 1 0 5' arm Physcomitrella_patens mirnest mir-598 0.0006 100 -63.6 .((...))..((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((.......((((.(((((((.....(((((......))))).....))))))).))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))))))))))).((....)) (-63.6)